新加坡杜克大学-新加坡国立大学医学院的一个团队领导的研究发现，东南亚的猪流感病毒储存库活跃程度惊人。他们的研究追踪了这些病毒的进化起源并确定了迁移模式。

　　在《美国国家科学院院刊》发表的一篇题​​为“东南亚甲型猪流感病毒基因组景观”的论文中，研究小组详细介绍了柬埔寨猪群中多个猪流感谱系的共同循环，包括多种重配病毒及其遗传起源。

　　2020年3月至2022年7月，研究人员对柬埔寨18家生猪屠宰场进行了猪流感监测。他们从四个省不同地区的生猪身上采集了4089份鼻拭子。其中，72头猪(1.8%)甲型流感病毒检测呈阳性，与其他省份(0.2%至1.8%不等)相比，干丹省的阳性率最高(4.5%)。

　　他们分析了 45 个鼻拭子样本的完整或部分猪流感基因组。鉴定出 H1 和 H3 HA 亚型以及 N1 和 N2 NA 亚型，并观察到共同感染。主要亚型是 H1N1，存在于 82.2% 的测序样本中。

　　系统发育分析揭示了柬埔寨境内流通的 H1 病毒谱系多种多样，其中大多数 H1 和 N1 序列是人类 H1N1/pdm09 谱系的衍生物。22.2%的样本中发现H3流感亚型，通常与H1N1/pdm09病毒共同感染。

　　虽然目前的研究对柬埔寨的猪进行了采样，但整个东南亚都报告了这一问题，并且与世界其他地方的病毒库有关。例如，检测到欧洲禽类H1N2。研究结果还表明，北美猪的 N2 片段可能在 15 年前就被引入亚洲。

　　从流行病学家的角度来看，这种引入应该在十多年前就被注意到，以便能够对疫情爆发或传染给人类做出反应。这需要对猪流感病毒进行系统监测，而东南亚尚未进行这种监测，而且许多国家的遵守情况也有限。

　　从养猪户的角度来看，没有任何迹象表明存在潜在问题，猪的健康没有任何问题，也没有任何外在迹象表明它们携带多种形式的甲型流感，而且它不会影响猪肉产品或食品健康。

　　监测病毒的成本很高，并且需要一套与典型养猪场不同的技能。不受监控的家猪种群充当多种形式流感的储存库，并可能重新组合成致命的大流行，其后果可能要严重得多。

　　在 SARS-CoV-2 之前

　　在 COVID-19 成为家喻户晓的名字之前，流行病学家最关心的流行病是甲型流感病毒。甲型流感病毒存在于一些野生动物体内，并且在找到家畜宿主之前，它往往会保留在那里，不会影响大量种群。从那里开始，病毒与其他动物和人有了更密切的接触，并开始适应其他宿主。甲型流感病毒的一种变种也是导致禽流感的原因。

　　1918 年的“西班牙流感”很可能是在美国的一个养鸡场传播的，但首先被驻扎在西班牙的士兵发现，它是一种源自禽类的 H1N1 流感病毒。1918 年至 1919 年间，疫情感染了全球约 5 亿人，即世界人口的 33%，导致约 5000 万人死亡。

　　2009 年，猪流感(也称为 H1N1 流感)大流行感染了全世界数百万人，由于世界各地科学家的快速工作，人们可以通过每年注射流感疫苗、橙汁和抗病毒药物来预防 H1N1 流感。即使采取了疫苗接种措施，甲型流感病毒估计每年仍会导致全球约 45 万人死亡。